Исследования микробиома все чаще показывают, что микроорганизмы, обитающие внутри и на поверхности человеческого тела, важны для организма. Сейчас ученые из Перельмановской медицинской школы при Университете Пенсильвании (Perelman School of Medicine at the University of Pennsylvania) исследовали популяции вирусов — виром.
Элизабет Э. Грайс (Elizabeth A. Grice) отмечает, что раньше подобных работ проводилось очень мало из-за технических ограничений: обычный кожный мазок содержит в основном человеческую и бактериальную ДНК, и лишь малую его часть составляет генетический материал вирусов.
В исследовании брали пробы с ладоней, лба, подмышек, пупка и других частей тела 16 здоровых человек. Ученые воспользовались методами выделения вирусоподобных частиц и анализировали очень небольшое количество генетического материала вируса. Чаще других встречался папилломавирус человека. Однако, более 90% обнаруженных вирусных генов отсутствовали в базах данных и были плохо изучены. Наиболее разнообразный набор вирусов был обнаружен на сгибе руки.
Кроме того, большая часть вирусной ДНК принадлежала бактериофагам – вирусам, поражающим бактериальные клетки. Это свидетельствует о взаимосвязи между кожным микробиомом и виромом. Секвенирование бактериальной ДНК, выделенной из образцов, взятых с кожи 16 участников эксперимента, показало, что в геноме бактерий присутствуют CRISPR-повторы, свидетельствующие об атаке фагов на кожные бактерии. Все это свидетельствует о тесном взаимодействии вирома и микробиома.
В ближайшее время ученые планируют идентифицировать вирусы, присутствующие на коже человека, а также изучить, как прием антибиотиков, действие ультрафиолета и другие факторы влияют на виром.
Последние комментарии